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中美洲正在和一種造成咖啡樹枝葉乾枯甚至整樹死亡的真菌大戰，這些真菌已肆虐中美洲三分之一咖啡樹，嚴重威脅這個地區的生命產業。

中美洲許多人全家靠咖啡業度日，超過150萬人賴此就業。這裡種的是阿拉比卡豆。

去年9月，也就是年度收成前兩個月，稱為「葉鏽菌」的真菌開始蔓延。專家、政府官員和業界人士說，蔓延主因是沒有對治辦法，以及高溫和乾旱等氣候變遷因素。尼加拉瓜咖啡外銷協會表示，「問題非常嚴重，要是不採取措施，還會更糟。」

這種葉鏽菌學名駝孢鏽菌 (hemileia vastatrix)，造成咖啡樹葉、枝條和幼芽枯死，影嚮開花和結果，嚴重者整株光禿枯死。

葉鏽菌在中美洲95萬8000公頃的咖啡園中已肆虐35%，相當於200萬袋 (每袋46公斤)咖啡豆要報銷。以目前每袋150美元(台幣4350元)計算，等於損失3億美元(台幣87億元)。

2011～2012年那一季，中美洲出口175萬袋咖啡，帶進36億美元，指望本季更上層樓。這個收成季是11月到2月。

中美洲咖啡園有30多萬園主，大多是中小型經營，沒有多少資本可以防治咖啡病。

尼加拉瓜農業部表示，政府和咖農有幾個辦法可以試試，包括剪掉受病的葉子、架設有效的遮護，以及改用抗真菌的種子取代枯死的咖啡樹。

薩爾瓦多「咖啡研究基金會」建議土壤加肥和剪掉枯葉。葉鏽菌在枯葉上不能存活。「中美洲國際植物保護與動物衛生組織」 (OIRSA)支持這些措施，但普遍財力有限，希望向外國貸款。

初步估計，瓜地馬拉需要8億4300萬美元來投資更新咖啡園，尼加拉瓜需要2億。

葉鏽菌災情各地有別，但宏都拉斯和尼加拉瓜由於以咖啡為主體，損失最重。咖啡占宏都拉斯出口22%，相當於14億美元，占尼加拉瓜出口18%，相當於5億1900萬美元。

宏都拉斯是中美洲的咖啡王，真菌為害28萬公頃咖啡園中的10%。尼加拉瓜12萬8000公頃咖啡園有30%毀於真菌，政府和業界正在想辦法周濟3萬5000咖農。

瓜地馬拉「全國咖啡協會」警告，全國27萬4000公頃咖啡園已有67%被葉鏽菌籠罩。薩爾瓦多16萬1000公頃咖啡園可能必須廢耕。